Hay varias teorías respecto al origen del nombre Paco, y estas son las más comentadas:
Una es que Paco es una abreviación de Pater Comunitatis (Padre de la comunidad), forma que se usaba para referirse a San Francisco de Asís. Sin embargo esta teoría es poco probable ya que en el siglo XII (época en la que San Francisco de Asís vivió) era extremadamente reducido el número de personas que sabían leer y escribir, por lo que difícilmente se pudo haber hecho popular esa abreviación en ese tiempo.
La teoría más aceptada es que el nombre Paco deriva de una malformación en la pronunciación, pues si a un niño llamado Francisco le preguntas su nombre seguramente responderá: -Paquico.
Por esta razón es muy probable que anteriormente a los niños llamados Francisco les llamaran Paquico de cariño, pero al crecer debían eliminar el diminutivo de Paquico y cambiarlo por Paco.